我國科學(xué)家繪制完成毛白楊基因組序列框架圖
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- 時間:2011/7/6 9:43:27 來源:科技日報
我國林木基因組學(xué)研究取得突破。北京林業(yè)大學(xué)的科學(xué)家們選用百年古樹作為測序的樣本,利用最新的全基因組鳥槍法測序和拼接策略,繪制完成了毛白楊的基因組序列圖譜,標(biāo)志著毛白楊分子育種進(jìn)入基因組時代。
在“985”平臺建設(shè)資金支持下,北林大林木育種國家工程實驗室的專家們用短短的6個月完成了這一開創(chuàng)性的研究。
專家解釋,基因組學(xué)研究成果在育種中應(yīng)用后,將拓展野生種質(zhì)資源中優(yōu)異等位基因挖掘的廣度和深度,顯著提高復(fù)雜性狀改良的可操作性和新品種選育的效率,對于保障我國森林資源可持續(xù)發(fā)展有十分重要的意義。
北林大繪制完成的毛白楊基因組序列圖譜開創(chuàng)了我國林業(yè)基因組學(xué)研究的先河。據(jù)介紹,科學(xué)家們完成的毛白楊基因組大小約為6億個堿基對,重疊群的平均長度為39.7Kb,達(dá)到了框架圖標(biāo)準(zhǔn)。基因組常染色質(zhì)區(qū)覆蓋度達(dá)到90%以上,基因區(qū)覆蓋度達(dá)到95%以上,單堿基的錯誤率達(dá)到1萬分之一以內(nèi)。
國際同行專家高度評價這樣一項重大研究。他們認(rèn)為,毛白楊基因組的注釋和分析大大便利了科學(xué)家發(fā)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)基因,使經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳圖譜定位,跨越到基因組圖譜和功能基因的精確定位,標(biāo)志著毛白楊分子育種等相關(guān)研究正式進(jìn)入基因組時代,將推動毛白楊育種技術(shù)的全面進(jìn)步。毛白楊基因組序列測序完成,對木本植物發(fā)育的分子機(jī)制的了解、木本植物在進(jìn)化歷程中地位的研究、可再生能源利用的研究具有重要的意義。
據(jù)悉,科學(xué)家們將在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步完善基因組序列圖譜,構(gòu)建物理圖譜和高密度連鎖圖譜,實現(xiàn)基因組序列圖譜與物理圖譜、連鎖圖譜的整合,繪制出毛白楊基因組精細(xì)圖譜,以保證基因組序列組裝和基因注釋的準(zhǔn)確性。
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